По этому поводу мнения священников и даже святых не просто разделяются, а как бы разветвляются. Было время, когда женщине категорически запрещалось посещать церковь во время менструаций, это шло из прошлого, когда женщина долгое время считалась существом более низкого порядка, чем мужчина. В христианстве женщинам категорически запрещено, например, женщинам входить в алтарь, исключение сделано только для монахинь, а при крещении мальчиков заносят в алтарь, а девочек нет.
Нечистой женщина считается не только во время месячных, но и после родов. Она должна пройти специальную процедуру очищения после того, как покрестят ребенка.
Конкретно мнения священников по поводу женщины с месячными в храме делятся на три варианта:
Первый - женщина нечиста, ей нельзя ходить в храм.
Второй - женщина нечиста, в храм ей входить можно, но нельзя прикасаться к святыням, нельзя причащаться и участвовать в других обрядах, например - нельзя собороваться, но она может стоять в храме и молиться, кроме того она может быть окроплена святой водой или кланяться при каждении вместе с остальными прихожанами.
Третий - женщина с месячными считается больной (болящей) и ей тем более нужно идти в храм, чтобы получить исцеление плоти, подобно тому, как исцелилась женщина от кровотечений, дотронувшись тайно в толпе до плаща Спасителя.
Так что единого мнения нет. Поступайте так, как подсказывает вам сердце.