Алексей Балабанов родился в Свердловске 25 февраля 1959 года. Служил в рядах В Советской Армии в военно-транспортной авиации с 1981 по 1983гг. События этих лет отразились в фильме "Груз 200". Участник войны в Афганистане. Недолго служил на флоте.
Несколько лет работал ассистентом режиссера в Свердловской киностудии. Окончил Высшие курсы сценаристов и режиссеров, режиссерское отделение. С 1990 года жил в Санкт-Петербурге. В первом своем игровом фильме снял группу Nautilus Pompilius. Был знаком с Вячеславом Бутусовым, руководителем группы. Фильм малобюджетный, в массовку играли посетители ресторан, где фильм снимался. В последующем Балабанов добивался наибольшей реальности фильмов участие в них малоизвестных артистов и простых людей с улицы.
В 1992 году совместно с продюсором Сергеем Сельяновым учредил кинокомпанию "СТВ". Все последующие фильмы снимал там.
Фильмы Счастливые дни" и "Замок" поражают искусно переданной атмосферой абсурда и клаустрофобии.
Фильм "Брат" принес Балабанову известность. Он стал культовым фильмом 90-х. Сергея Бодрова, исполнителя главной роли в этом фильме называли героем поколения.
Фильм "Про уродов и людей" Балабанов снял в 1998 году. Сценарий лежал пять лет, фильм не могли снять из-за нехватки денег. Сюжет фильма о производителях порнографии в царской России. Но не смотря на это, фильм получил премию "Ника".
В 200о году снял фильм "Брат-2". затем фильм "Война", о военных конфликтах на Северном Кавказе. Его постоянно обвиняли в национализме и ксенофобии.
Затем последовало два легких фильма:комедия "Жмурки" и мелодрама "Мне не больно".
В 2007 снял фильм "Груз 200". Был обвинен в излишнем натурализме поздней советской действительности. Показал страшную изнанку жестокости человеческой натуры, чем вызвал отказ многих известных актеров сниматься в картине. Лента была снята с показа во многих регионах России. Фильм "Кочерга", снятый в 2010 году повествует о якуте, участнике войны в Афганистане.
последний фильм Балабанова "Я тоже хочу" пророческий. Там он снялся в маленьком эпизоде. Балабанов, как режиссер, пытался показать, осмыслить проблему ухода из жизни.
Умер Алексей Балабанов 18 мая 2013 года от сердечного приступа в санатории "Дюны" в Сестрорецке, где работал над очередным сценарием. Похоронен на Смоленском кладбище в Санкт-Петербурге. Умер в возрасте 54 лет.
Многие события жизни Балабанова отображены в его фильмах.