Имеется в виду инструкция по сборке дорогостоящей мебели? Или чего другого, например, копеечной модели автомобиля? Это несколько разные вещи, которые требуют разного подхода. В первом случае, как правило, в инструкции пишется, даже иногда обычным, а не мелким шрифтом, что собирать данную конструкцию должны специалисты, имеющие соответственную подготовку. Которым инструкция может понадобиться для уточнения мелких нюансов. А чаще всего, вообще не нужна. И также в инструкции обычно пишется, что в некоторых случаях могут быть мелкие несовпадения, не ухудшающие эксплуатационных параметров изделия. Это может быть сказано несколько другими словами, но смысл именно таков. Поэтому, решившись на самостоятельную сборку, вы должны быть готовы к этим мелким (а иногда и вовсе даже не мелким) несоответствиям. Попробуйте составить для себя общую картину, как должна выглядеть конструкция, и насколько все ее комплектующие совпадают с этой картиной. И, включив логику и фантазию, начинайте действовать. Если же знаний и опыта окажется маловато, то придется искать опытного специалиста для консультации или же выполнения работ, которые оказались не по силам для самостоятельного выполнения. Еще вариант - зайти на сайт изготовителя (при его наличии) и поискать решение там.
Если же речь идет о детском конструкторе, то здесь некоторые несоответствия можно даже приветствовать, ведь конструктор предназначен не только для отработки навыков сборки по готовым чертежам и рисункам, но и для развития мышления и фантазии. В итоге дети зачастую собирают такие самоделки, о каких в инструкции даже и речи не шло.