В этом выражении имеется ввиду, что оскорбив, обидев, предав человека, не поможет никакое извинение.
Даже если человек простит или сделает вид, что простит, в душе останется осадок и неизгладимый след.
Всё можно попытаться простить, но не всё удаётся забыть, поэтому не зря говорят в народе - слово - не воробей, вылетит - не поймаешь.
Вбивая гвоздь в душу человека ( обида, оскорбление, предательство), вытащив его своими извинениями ( раскаявшись, принести извинения, пытаясь загладить свою вину), всё равно оставите там дыру (обида, недоверие, осадок и неизгладимый след).
Чтобы не каяться и не извиняться, посыпая голову пеплом, лучше вовремя остановиться.