Если не учитывать ограничения в сезон размножения и ограничения на ловлю некоторыми способами тех или иных рыб, то в пресных водоймах запрещено ловить только краснокнижные виды. Других ограничений в ловле каких либо видов больше нет.
В Красную книгу РФ занесены следующие виды рыб:
Калуга, Белуга, Осётры (атлантический, сахалинский, амурский, сибирский), Шип, Стерлядь, Волжская сельдь, Атлантическая финта, Абрауская тюлька, Озёрный лосось, Кумжа, Микижа, Арктический голец, Малоротая палия, Длиннопёрая палия, Таймень обыкновенный и сахалинский, Ленок, Нельма, Сиг волховский и баунтовский, Переславская ряпушка, Карликовый валёк, Европейский хариус, Вырезуб, Днепровский усач, Азово-черноморская шемая, Русская быстрянка,
Желтощёк, Чёрный амур, Чёрный амурский лещ, Мелкочешуйный желтопёр, Предкавказская щиповка, Сом Солдатова, Бёрш, Ауха, Подкаменщик, Кильдинская треска.