Существительное фактура -- это слово-термин, который используется и в искусстве, и в музыке, и в литературе.
Сочетание счёт-фактура связано с торговым правом.
И по существу термин фактура означает то же самое, что и термин счет.
Но есть здесь нюанс.
Когда мы покупаем в магазине товар, здесь его оплачиваем и забираем с собой, то можем попросить выписать счет на него, в котором указаны род товара, количество и цена отпущенного товара.
Например, при покупке школьных принадлежностей выписываем счет для отчетности.
В том случае, когда товар заказывается и присылается из одного места в другое, в пункт, отдаленный от места продажи его, то то к стоимости товара добавляются еще всякого рода издержки по перевозке, по упаковке и другие так называемые накладные расходы.
Вот такой счет принято называть фактурой.
Сочетание счет-фактура совмещает опись присылаемого товара с затратами на оказанные покупателю услуги по доставке товара.
Это сопроводительный документ, и, кстати сказать, счет-фактура - необходимый документ для подтверждения права налогоплательщика на возмещение НДС.