Вот такие глубинные карты можно увидеть на сайте Российской спиннинговой лиги. Карты лоции глубин рек, водоемов и водохранилищ Псковской области европейской части России.
Сайт посвящен рыбалке, соревнованиям команд и всему что с этим связано.
Странно, что в вопросе уже содержится ответ. Действительно левым притоком реки Вилюй на букву "Ы" и указанным количеством букв является река Ыгыатта, что на западе Якутии. Длина реки чуть более шестисот километров. Здесь ведётся промышленная добыча золота. Глубина Ыгыатты колеблется в зависимости от количества осадков, поскольку река подпитывается большей частью дождевой и талой снеговой водой. Мой ответ - Ыгыатта.
Борито - река на остраве Калимантан. Протекает это река в основном по провинции центральный Калимантан. Длина её около 880 километров. По ней перевозят каменный уголь, которые добывают на её берегах. Глубина реки достигает до 8 метров.
В связи с пояснением к вопросу сканворда о "крокодиловой" реке, сразу вспоминается сказка К.И.Чуковского про доброго доктора Айболита. Вот там упоминается река Лимпопо, в которой было много крокодилов.
На некоторых реках часто бывает пространство, глубоко врезавшееся в берег, причем значительных размеров. На крупных реках это пространство используется для стоянки, зимовки и ремонта судов. Вода в здесь стоячая. На малых речушках в таких местах водится рыба, как правило карась. Рискну предположить, что такой залив из 5 букв носит название затон.