Неверная предпосылка, что духовная и светская столица есть сравнимые понятия и что их специально разносили.
Светская столица, во первых, просто место, где сидит начальство, во вторых, связано соответственно с функцией управления. Бывало, что таких столиц бывало по две: Римская империя в период расцвета имела две столицы: Рим и Византий (после окончательного раскола - Константинополь), Российская империя от Петра до СССР: Москву и Питер.
Чаще всего духовная "столица" находилась там же, где административная ввиду того, что там была напряженная движуха с которой и работали верховные пастыри. Самый яркий пример до сих пор - Рим. Больше и активнее паства - больше работы с душой (и церковные сборы с пожертвованиями). Случаи когда духовные столицы не совпадали с административными были скорее исключениями и связаны с историческими событиями и святыми местами, пример: Мекка.
Случаев искусственного переноса столицы очень мало. Навскидку вспоминается только Канберра и Астана. Может еще какие были, но не вспоминаются сходу.
А из духовных можно вспомнить перенос Митрополичьего престола из Киева во Владимир. Но этот перенос был вынужденный из-за преследований православия властями ВКЛ. Потом кафедра переехала в Москву, в административный центр, по указанной выше причине. Потом кафедра стала Патриаршей...