Вообще говоря, поминают тем, что оказалось под рукой...
Но да, принято поминать - действительно водкой. Хлебом же - не уверен, хлеб принято класть на стопку водки, ритуально предназначающиеся поминаемому.
Предположу, что причина - традиция.
Хлеб и водка - современный, самый простой и доступный аналог архаичных браги, каши, кутьи... и хлеба.
Поскольку именно эти блюда/продукты использовались нашими предками-язычниками во всех ритуальных трапезах: злаки (каша), злаки, ягоды, фрукты (кутья), хлеб, брага/молодое вино/пиво (напитки брожения). Все это символизировало рождающую силу природы, жизнеутверждающее начало. В случае поминок - в противовес смерти.
Проще говоря, изначально это утверждение жизни, как бы "закрывая" смерть обрядовой трапезой и погребальными состязаниями/играми.
Теперь этот аспект ритуала, естественно, прочно забыт. Осталась лишь внешняя сторона: поминовение ритуальной пищей - все той же кутьей (уже в современном варианте), хлебом и водкой. Причем допущу, что водка тут символизирует горечь потери. В противовес древнему утверждению жизни, несмотря на смерть - что символизировала горькая водка (да ее тогда и не было), а сладкая игристая брага/молодое вино.
Вот так как-то очень вкратце.