Президент и царь - это разные вещи.
Царь - это наследуемый титул, и даётся он по праву рождения. И поскольку монархия относится к традиционной форме правления, то и многие её аспекты связаны с религией.
Президент - это должность, профессия, если можно так сказать. Должность выборная и относится исключительно к светской власти.
По поводу отношения религии и власти, тут всё не так однозначно.
В христианстве, например, любая власть исходит от Бога. Бог хранил и царя, и коммунистов, и президентов, поскольку, раз они пришли ко власти, значит, Богу было так угодно. Но поскольку президент - это светская власть, то в гимне упоминать его связь с Богом смысла не имеет. Царь же связан с религией, и некоторые особенности данного титула носят сакральный смысл. Например, царь мог иметь два церковных брака: с земной женщиной и с Родной Землёй. Пусть звучит это странно, но по сути так и есть. С уроков истории в школе мы помним такое выражение "венчание на царство". Значит, царь и с Землёй ещё был повенчан, регистрировал с ней церковный брак, так сказать. И многие другие аспекты связывали царя с религией.
Так что президент связан со светской властью. Он может быть любой религии или вообще агностиком/атеистом. Так что связывать его напрямую с Богом, в особенности в гимне, не совсем уместно.