Да, "над" может быть как приставкой, так и предлогом. Но если мы говорим о приставке у существительного, то с ней слово может писаться даже в именительном падеже. Если же мы говорим про существительное и предлог, то первое будет находиться в творительном падеже.
Например:
Пленка, покрывающая кость, называется надкостницей.
Он не успел и надломить печение, как мать заметила его маневры.
В данных случаях приставка есть и у существительного, и у глагола.
Например:
Над лесом повисли грозовые тучи.
Какой город находится выше над уровнем моря?
Тут уже предлоги идут с соответствующим существительным, но не стоят перед глаголом.