Если Ваш работодатель решил перечислять зарплаты на карты (зарплатный проект), то, скорее всего, он сам заключит договор с определенным банком, и Вы дружным коллективом получите карты именно этого банка.
Что касается отличий, то зависит от того, как Вы распоряжаетесь своими деньгами.
Например, я получаю зарплату на карту Сбербанка, но сразу же ее перекидываю на Кукурузу (7% на остаток денежных средств) или Тинькофф (6% на остаток денежных средств). Снимаю же наличные 2-3 раза в месяц небольшими суммами на текущие расходы. В магазинах чаще расплачиваюсь картой (где есть такая возможность). Таким образом, основная сумма моей зарплаты, по крайней мере, часть месяца приносит пусть небольшой, но доход. Плюс к этому, безналичная оплата картой приносит небольшой кэшбек (возврат): Кукуруза - 1,5% баллами (потратить можно в магазинах-партнерах), Тинькофф - до 5 % деньгами (1% за каждые потраченные полные 100 руб. в любом магазине, 5% - по определенным категориям). Даже Сбербанк дает 0,5% "спасибами" (тратить можно в магазинах-партнерах).
Если Вам позволяет финансовая ответственность, то можете завести еще и кредитную карту (но только, если уверены, что не будете забывать вовремя гасить задолженность).
И да, по поводу сберкнижки: у Сбербанка есть "милое" правило: деньги, поступившие на счет от юрлиц (в том числе, работодателя), должны отлежать 30 дней; в ином случае при снятии денег возьмут комиссию 1%. На карты это правило не действует.