Алфавитом. В идо нет букв с надстрочными знаками - ĉ, ĝ, ĥ, ĵ, ŝ, ŭ.
Звук "ч" передаётся как "ch", "ш" - как "sh".
Деталями грамматики. В эсперанто действует принцип "необходимости и достаточности", в идо - "обратимости". Поэтому, в частности, в идо нельзя образовать отглагольные существительные без суффикса, обязательно нужен какой-то из суффиксов - es, ag, iz.
В идо нет понятия грамматической категории корня.
В целом, по словарному составу, идо более приближен к романским языкам - и поэтому труднее для носителей других языков.
Жизнь показала, что все эти "улучшения" - только во вред. На эсперанто накоплена богатейшая культура, литература, изданы десятки тысяч книг (оригиналов, а не только переводов). На идо литературы, можно считать, нет. Число носителей идо измеряется сотнями, эсперанто - миллионами.