Пословица - это элемент устного народного творчества, а то, что процитировано в вопросе, могло возникнуть лишь в советское время и лишь в качестве очень неудачного примера антирелигиозной пропаганды.
"Не нужным" может быть лишь то, без чего можно обойтись. Оно есть, но ты свои проблемы решаешь без него, в данном случае - без Него, без Бога. Получается, что Бог есть, но ты пользуешься его суррогатом. Наука как суррогат Бога - это оскорбительно по отношению к учёным и по сути неправильно, ибо нелогично.
Бог в любой религии - источник жизни, вселенной. Наиболее чётко это выражено в авраамических религиях (иудаизме, христианстве, исламе): Бог (Б-г, Аллах) создал всё и всех, точка. Наука (опять же - любая) изучает мир. Создавать наука начинает лишь очень опосредованно и лишь на очень высокой стадии развития, причём это область для прикладной, а не фундаментальной науки.
Картина, при которой дяденька с умным видом в белом халате создаёт штуковину, в которой мигают лампочки, конвейер двигается и из положенной на входе какой-то неясной дряни на выходе выплёвывается бочка гуталина или канистра майонеза - чрезвычайно примитивная, и возникнуть она могла лишь в СССР эпохи индустриализации и ликвидации безграмотности. Её ещё можно увидеть в детских мультфильмах, а в комическом виде - в экранизации "Ивана Васильевича" Булгакова, где "демиург" Шурик придумал и сделал машину времени.
Впечатлить она могла лишь язычника, к которому прилипло православие (или ислам), но который обращается к Высшей Силе лишь с одной целью - что-нибудь попросить. Здоровье, богатство, удача, бочка майонеза и т. п. должны взяться силой чуда - боженька позволил, значит, откуда-нибудь возьмётся. Для такого человека шайтан-машина, в которой достаточно потыкать кнопки руками, чтобы возникло желаемое, если не здоровье и удача, то хотя бы гуталин, - действительно заменяет его закамуфлированного языческого божка. Для него и божок, и наука заняты одним - сбычей его сугубо материальных мечт.
В такую "религию" прекрасно вписываются карго-культы некоторых отсталых островных племён, которым во время Второй мировой по ошибке случайно были сброшены ящики с провизией для американской армии. Для них ценность имеет лишь ящик с замысловатыми полезными штучками, которые можно съесть, а можно и под-что-нибудь приспособить. Кто поставляет штучки - тот и "бог": Всевышний, тригонометрия, лётчик ВВС США... хотя правильнее его было бы назвать Тумбочкой - той самой, из которой берутся деньги...
Так что в этой псевдопословице - извращение сути как науки, так и Бога. И если её действительно придумал атеист, то было он не "прожжённым", а невероятно тупым, как пустая тара.