Мне кажется, дело даже не в чае, как в лекарственном воздействии, а в привычке, ритуале, знакомом вкусе.
Она просто привыкла засыпать после определенного действия.
Лекарственные травы, даже такие простые как ромашки даются курсами, во время болезни или стресса. Слишком частый прием может вызвать аллергию, например.
Меняйте ритуалы.
Допустим, в 9 вечера выключаете все, полная темнота. Укладываете ребенка и ложитесь сами. Не будет же она в темноте скакать, да когда все спят. Ляжет потихоньку, пусть даже просто лежит, успокаивается, это не страшно. Постепенно будет привыкать.
Либо укладывайте и читайте книгу, пусть засыпает под нее. Вставать разрешать только на горшок и попить.
Можно попробовать заменить ромашковый чай на обычный или молоко. То есть, вы половине чай, вроде и вкус знакомый, а вроде и что то другое. Постепенно процент ромашки в напитке снижаете.