Скука и лень, на мой взгляд, это два разных состояния человека.
Скука появляется, когда человек пресыщен жизнью, ему ничего не интересно, он не любит работать, не способен к творчеству.
Лень же, появляется, когда человек устал от множества дел и ответственности, которые довели его организм до морального и физического истощения.
То есть, в данном случае, лень - это защитная реакция организма.
Не случайно говорят, что отдых необходим, что полениться иногда полезно.
Конечно, всё что написано мной, достаточно поверхностно, но как вариант объяснения разницы тоже вполне подходит.
В дополнение: скука часто посещает людей ограниченных умственно, которые не образованы, не любят читать, размышлять, не умеют ничего создавать.