Вариантов происхождения котловин очень даже много.
Тектонические процессы порождают трещины, разломы и опускания земной коры. От этих явлений образовались Байкал, Великие Африканские и Северо-Американские озёра, Титикака и многие другие. Они очень глубокие, имеют достаточно крутые склоны.
Есть менее глубокие и не очень большие по площади, но тоже крутые. Это озёра, образовавшиеся в кратерах вулканов на Камчатке, в Новой Зеландии и на Яве.
В конце ледникового периода, когда при таянии ледников отлагались переносимые ледовыми щитами материалы, образовывались порождённые этими отложениями гряды и холмы. Понижения между ними со временем заполнялись водой и также превращались в озёра.
Часть мягких пород в горах (известняки в основном), размывалась водой и проседала, образуя в последствии так называемые карстовые озёра.
В тех же горах в результате схода лавин, обвалов могут образовываться запрудные озёра: Севан в Армении, Сарезское озеро в Таджикистане.
Прибрежные лиманные озёра возникают из-за образования песчанных в основном кос, намытых морскими приливами.
Реки меняют своё течение, и их старые русла, обособившись от основной реки превращаются в озёра-старицы.
В результате понижения уровня мирового океана на месте отступивших морей возникают реликтовые (остаточные) озёра. В том числе и самое большое по площади море-озеро Каспийское.