Я не вижу в таком "величании" по имени-отчеству и маленькой Машеньки, и кого-то ещё , практически ничего, кроме шутки. Такие шутливые обращения в семье (на "вы" вместо на "ты, "Александра Александровна" вместо привычного всем "Сашенька" и так далее) - явление нередкое и выполняет свои небольшие психологические функции, некоторые из которых я хочу описать ниже.
Если совсем ещё маленького человека, ребёнка, а может быть и подростка в семье иногда называют, например, не Ваней, а Иваном Ивановичем, если в третьем лице, то этим самым хотят показать просто подчеркнуть, что он ещё маленький, но очень важен для всей семьи. Звучит такое обращение порой невероятно смешно, поэтому никто и никогда не обижается, что человек вот так пошутил.
Если так называют супругов или кого-то ещё из числа взрослых, то я бы разделила немножко несколько ситуаций. Муж и жена, если изредка так о себе говорят, то хотят разнообразить обращения, могут искать разные варианты. Вместо "мой мышонок" звучит, например, "Николай Николаевич", и ничего страшного. Не буду против, если женщину где-то её муж назовёт не "ягодка моя сочная", а "Лукерья Игнатьевна". Когда же имя-отчество не имеют никаких альтернатив, то иногда создаётся впечатление, что просто по имени называть почему-то не хочется, производится какой-то уход от просто имени. Наверное, нужно разбирать каждый случай, чтобы понять причины. Может быть, как повелось с самого начала, так и продолжается по сей день.