Молитва после пробуждения и перед засыпанием действительно имеет особое значение. Не случайно, в молитвословах отдельно выделены: утренние и вечерние.
Сон - очень сакральное состояние, мини-смерть как бы... Где бывает душа и что с ней делают доподлинно неизвестно. Поэтому вечер - это время перехода от суетного состояния сознания к его утишению-умирению для лучшего перехода, чтобы он прошёл с пользой, а не расхитил, например.
И утро так же: важен плавный переход из "иномирья" в повседневность, так сказать, настрой сознания.
Важна не "начитка" правила там или ещё чего, а именно сознательное отношение. Уделение этому какого-то внимания. Молитва хороша тем, что обращена адресно и сразу на весь день "ставит", если можно так выразиться, защиту и благословение. В общем, важно "прочистить дымоход", а уж как ты будешь это делать - дело 16-е...
Я лично сначала пользовалась молитвословом (и это полезный навык), теперь без него настраиваюсь - очень хорошо утром выйти на улицу, услышать первых птиц, посмотреть на солнце. Утром самые благостные вибрации, на мой взгляд.