Исторически сложилось так, что при зависании программы, необходимо было её "снимать" с выполнения или даже выключать Вычислительную машину.
Так на первых Электронных Вычислительных Машинах (ЭВМ) серий типа МИР, Минск, БЭСМ был предусмотрен режим Автоматического Останова (АВОСТ). На сколько я помню, его можно было вызвать вручную, нажав 2 клавиши, расположенные в разных местах пульта управления.
С появлением Диалоговой Операционной Системы (DOS) для Персональных Компьютеров задача перезагрузки ОС без выключения ("горячий старт") оставалась. И для повышения безопасности от случайного нажатия клавиш во время выполнения программ было решено использовать 3 клавиши управления.
Первоначально для "горячего старта" использовалась комбинация Ctrl+Alt+Escape. Эти клавиши, в принципе, можно нажать одной рукой одновременно (или всей рукой случайно).
Использовать именно клавиши Ctrl+Alt+Del предложил инженер команды IBM Дэвид Брэдли, разрабатывающий BIOS. Популярность этой управляющей комбинации принёс Билл Гейтс, который "раскрутил" MS DOS.