Тут многое зависит еще и от сорта древесины и от того каким сверлом и что именно Вы планируете прикручивать.
Но если речь идет о черном шурупе-саморезе под дерево стандартного (самого распространенного 3,5 или 3,8 мм) диаметра и небольшой длины (например, 25 или 40 и даже 70 или 100 мм), то лично я засверливаю сверлом диаметром 2 мм, иногда 2,5 мм.
Что касается глубины, то тоже зависит от разных факторов, но чаще всего целесообразно засверливать на глубину около 2/3 или 3/4 длины.
Если сверло потоньше, например, 1,5....2,0 мм, то можно засверлить на глубину всего самореза.
Тонкое сверло - лучше, потому что саморез будет прочнее сидеть в дереве, но тонкое сверло легко сломать.
Еще, особенно если дерево твердое (дуб, бук, ясень), то было бы правильно зенковать место под шляпку. Для этого используют специальный зенкер, либо сверло большого диаметра.
А вообще, Ваш вопрос не имеет однозначного ответа, потому что нужно учитывать ряд сопутствующих обстоятельств (твердость дерева, какой саморез, какая крепость соединения нужна и др)