Потому что такое решение япринял Жуков, который отвечал за подготовку парада Победы. Причина: недостаточный уровень строевой подготовки знамённой группы на генеральной репетиции. При том, что времени для подготовки других знаменосцев уже не было.
В защиту знамённой группы можно сказать только то, что это были не воины почётного караула, а бойцы фронтовики: Егоров, Кантария и Берест. К тому же знамёнщик капитан Неустроев имел несколько ранений, в том числе в ногу.
По приказу Жукова Знамя Победы было передано в Центральный музей Вооружённых Сил.
Но лично мне кажется, что это было решение Сталина. Потому что это Знамя в то время по сути являлось только одним из многих штурмовых флагов на уровне дивизии. В то время как на парад Победы выносились окроплённые кровью павших бойцов штандарты прославленных фронтов, легендарных танковых армий и многократно орденносных корпусов. И возглавлять всё это штурмовым флагом одной дивизии, пусть даже установленного над Рейхтагом, было не совсем правильно. И как то принижало роль в той войне других армий и фронтов. Сталин в таких вопросах был очень щепетилен.
Знамя Победы тогда было знаменем взятия Берлина. Ну а если его роль была бы действительно так значима, то Сталин не позволил бы отменить его вынос из-за хромоты знаменщика. Раненую собаку он же разрешил вынести на парад на своей то ли шинели, то ли кителе. Разные источники дают два варианта.