В вопросе Вы перечислили слова, означающие микроорганизмы. Одно из этих слов напрямую указывает на это, имея приставку "микро-" и, по сути, не имея ничего, кроме этой приставки (я имею в виду "микроб", у слова и корня-то толкового нет, он представляет собою "микро" и больше ничего).
Так вот, если включить свою "простонародную голову", то мы увидим, что у каждого из этих трёх научных терминов есть свой собственный "кухонный" оттенок. Но именно в нём и кроется разница. Как и всё сложное скрывается в самом простейшем.
Итак, все эти организмы - биологические, живые, движущиеся, питающиеся (непонятно чем и кем, но они же питаются! нами с вами, наверное, незаметно), но..
Вот здесь и начинается самое главное:
Вирус.
Это понятие имеет немножко негативный оттенок. Где бы он ни завёлся, он всюду вредит. И в горле, и в животе, и в компьютере. Ну, нет от него никакой значительной пользы, в нашем обывательском понимании.
Микроб.
Звучит куда официальнее. Даже как-то гордо: "Я - микроб!". И мы, увидев (не его, а слово, конечно), начинаем думать: "Да, а ведь это нечто серьёзное. Может быть, иногда и необходимое. Может быть, микробы устраивают между собою войну. И одни пожирают других. Те, кто победили, остаются живыми, но сытыми. И не кушают нас. В общем, микробы - это немножко получше, чем вирусы. И мы их не так панически боимся (хотя, иногда и очень зря).
Бактерия.
Звучит немного унизительно. Ну что там - бактерия какая-то. Малявка. Пшик. Пузырёк мыльный. Ничто.
Но каждый начитанный человек, живущий в 21 веке и имеющий эпидемиологическую библиотеку, прекрасно знает: бактерии бывают полезными. Они, конечно, разрушители, в основном. Из-за них всё гниёт, прокисает, протухает, становится таким, как будто срок годности давно на исходе, верно? Ни цвета, ни вкуса, ни запаха толкового.
Но если бактерии вдруг исчезнут (например, на Марс переселятся), то на Марсе будет тогда жизнь (и Марсоход не нужен, я Вам и без него это гарантирую), а на Земле жизнь, к сожалению, замрёт. А потом и вовсе исчезнет.
Дело в том, что они хоть и маленькие, но их очень много. Вы даже не представляете, сколько их кишат в нас и вокруг нас. Нулей в голове не хватит, чтобы пересчитать.
Вывод.
Каждая бактерия, являясь микробом, может (если ей волю дать да в нужную среду перепроводить) может стать вирусом. Вот тогда держись, Землянин! :)