Во-первых, водоросли очень богаты питательными для растительноядного зоопланктона, растительноядных рыб и некоторых водных млекопитающих веществами. То есть их энергетическая ценность огромна. Водоросли, которые не покрыты хитовыми покровом (диатомовые) и не являющиеся токсичными, дают наибольший прирост биомассы консументов I порядка.
Водоросли - активные фотосинтетики, поэтому они играют огромную роль в обогащении водоемов и атмосферы кислородом. Правда, при отмирании водорослей большая часть кислорода поглощается и используется на гниение остатков водорослей. Но зато первые сине-зеленые водоросли как раз явились организмами, которые привели к первоначальному накоплению кислорода в атмосфере и изменению газового состава атмосферы (от метановой к азотно-кислородной).
Твердые скелеты водорослей, содержащих хитин или карбонаты, участвуют в образовании горных пород. Прежде всего мела, мергеля, известняка. Также водоросли с мягкими оболочками принимают участие в формировании торфа и озерных отложений - илов и сапропелей.
Можно из водорослей добывать полезные ископаемые - из морских это йод и фтор, из пресноводных и морских водорослей возможно получать лекарственные средства (спирулина и фукус содержат большие количества йода). Есть данные о том, что некоторые виды водорослей возможно использовать для борьбы с комарами или вредителями сельскохозяйственных культур.
Одноклеточные водоросли вместе с бактериями используют для биологической очистки сточных вод.
Однако водоросли приносят не только пользу, но и огромный вред.
Водоросли выделяют в воду токсичные вещества (могут тормозить развитие бактерий, фитопланктона, зоопланктона, рыб, земноводных, а также эти токсины могут привести к заболеваниям животных и человека)
Микроскопические водоросли - агенты "цветения" воды, цветение приводит к уменьшению содержания кислорода, увеличению содержания фенолов, углекислого газа, органических веществ.
Существуют и специфические токсины, которые выделяют отдельные водоросли - афанизоменонтоксин, микроцистистоксин, анабенатоксин и другие.
Водоросли приводят к нарушениям в системе водоподготовки, забивая фильтры и при хлорировании воды.
