Наворотами.
Ну вот простой аспект: процессор. Фирм, выпускающих процессоры для телефонов, всего-то то ли две, то ли три. Но каждая из них выпускает не один какой-то процессор, а целую линейку, и процессоры линейки отличаются своим быстродействием, своими дополнительными функциями, а прежде всего своей ценой.
Ещё проще: экран. Технологий экранов в целом всего две: светодиодная матрица (AMOLED) или жидкокристаллический (как правило, IPS). И тут тоже множество вариантов и нюансов. Какие-то дороже и лучше по параметрам, какие-то попроще и похуже. Какие-то поддерживают режим расширенного динамического диапазона, какие-то нет. В каких-то разрешение выше, чем в настольном мониторе, в каких-то средненькое. И, опять же, разница в характеристиках означает и разницу в цене.
Камера. Где-то три, а то и пять объективов, да ещё с цейссовской или лейковской оптикой, а где-то один. Где-то навороченный софт с "элементами искусственного интеллекта", где-то стандартное приложение, обеспечивающее базовый функционал, но не более того.
Ну и дополнительные плюшки и фенечки - NFC, тип разъёма, материалы корпуса, защита от воды, поддержка максимально возможного числа диапазонов связи...
Вот флагманы от рядовых смартфонов отличаются как раз тем, к какому концу списка по каждому параметру они ближе. Флагман - это значит, что в нём применяются самые новые и самые качественные на данный момент решения и по процессору, и по экрану, и по камере, и по интерфейсам, и так далее и так далее. Да, это получается дороже, подчас сильно дороже. Но а) это задаёт планку. Флагманы показывают, что может делать смартфон. И б) на это есть спрос, и немаленький. Есть масса людей, которым хочется иметь в кармане топовый по своим возможностям девайс и которые готовы за это платить.
Но точно так есть масса людей, которым достаточно базовой функциональности и которые не хотят, или не могут, переплачивать за навороты. В конце концов, даже рядовой смартфон за 5-9 тыр делает практически всё из того, что делает флагман (ну может крестиком не вышивает...), и на уровне, который данного чела устраивает. Мамы всякие нужны...