По правую сторону и левую сторону от позвоночника отходит мембрана из соединительной ткани, которая называется горизонтальной септою (перегородкой) и разделяет мышцы тела рыбы на дорсальную (верхнюю) и вентральную (нижнюю) части, которые называются миомерами. Плавание рыб осуществляется благодаря сокращению мышц, которые объединены сухожилиями с позвоночником. Миомеры в теле рыбы имеют структуру конусов, вложенных один в один, и разделенных перегородками соединительной ткани (миосептами). Сокращение миомеров через сухожилие передается на позвоночник, побуждая его к волнообразному движению — по всей длине тела, или лишь в хвостовом отделе. В целом мускулатура рыб представлена двумя типами мышц. «Медленные» мышцы используются при спокойном плавании. Они медленно оксидируются и содержат много миоглобина, который обуславливает их красный цвет. Метаболизм в них происходит благодаря оксигенации питательных веществ. Благодаря постоянному насыщению кислородом, такие красные мышцы могут долго не утомляться, и потому используются при длинном монотонном плавании. В отличие от красных, «быстрые» белые мышцы с не оксигенационном, а гликолеточным метаболизмом способны к быстрому внезапному сокращению. Они используются при быстрых внезапных рывках, при этом могут генерировать большую, чем красные мышцы мощность, но быстро утомляются. Также у многих рыб мышцы могут выполнять и некоторые другие функции, кроме движения. У некоторых видов они выполняют функцию терморегуляторов. У тунцов (Scombridae) благодаря активности мускулатуры температура мозга поддерживается на уровне высшем, чем в других частях тела, когда тунцы охотятся на кальмаров в глубоких холодных водах.
Электрические токи, которые генерируются при сокращении мышц, используются слонорылом как коммуникационный сигнал; у электрических скатов электрические импульсы, генерированные видоизмененными мышцами, используются для поражения других животных. Модификация мышечных клеток для выполнения функции электрической батареи эволюционно происходила независимо и неоднократно в разных таксонах: глазных мышц у рыб-звездочетов (Uranoscopidae), жевательной мускулатуры (электрические скаты) или осевой мускулатуры (электрические угри).
Мышечная система существенно отличается от мышечной системы рыб двумя основными особенностями, связанными с передвижением животных при помощи пятипалых конечностей и в известной мере по твердому субстрату.
Во-первых, развивается мощная и сложно организованная мускулатура на свободных конечностях.
Во-вторых, в связи со сложными движениями мускулатура тела более дифференцирована, а характерная для рыб ее сегментация у амфибии нарушена метамерия мышечной системы выражена более четко у хвостатых и безногих. В свою очередь у бесхвостых ее можно увидеть только, в немногих местах туловища у взрослых форм и в личиночном состоянии.
Часть туловищной мускулатуры сохраняет метамерное строение. Однако отчетлива и дифференцировка: обособившиеся участки мышечных сегментов сливаются в лентовидные мышцы. Резко возрастает масса мускулатуры конечностей, представленной сложной системой мускулов антагонистов: сгибающих и разгибающих суставы, приводящих конечность к туловищу и отводящих ее в сторону и т. д. Усложняется и специализируется мускулатура ротовой полости (жевательная, языка, дна ротовой полости), не только участвующая в захвате и проглатывании пищи, но и обеспечивающая вентиляцию ротовой полости и легких .
Описанные выше особенности позволили земноводным выйти на сушу и перемещаться в воздушной среде. Передвижение бесхвостых скачками увеличило их подвижность. Однако скорость и маневренность, важные при преследовании добычи и спасении от хищников, остаются невысокими.
Костная ткань это специализированный тип соединительной ткани с минерализацией межклеточного вещества, содержащего около 70% фосфата кальция. В грубоволокнистой ткани коллагеновые волокна образуют толстые пучки, идущие в разных направлениях, а в пластинчатой ткани костное вещество образует системы пластинок. В зависимости от расположения коллагеновых волокон в межклеточном веществе костные ткани классифицируются на:
1. Костную ткань, в которой коллагеновые волокна располагаются беспорядочно. Такая ткань имеется у зародышей (нагрузка на эту ткань у зародышей минимальная, поэтому не требуется её пространственная силовая ориентация). У взрослых она сохраняется на месте черепных швов и в прикреплениях сухожилий к костям.
2. Пластинчатую костную ткань, наиболее распространённую разновидность костной ткани во взрослом организме. Она состоит из костных пластинок, образованных костными клетками и минерализованным веществом с коллагеновыми волокнами, расположенными в определённом направлении. Благодаря этому достигается большая прочность пластинчатой костной ткани. Из этой ткани строятся компактное и губчатое вещество плоских и трубчатых костей скелета. Длинные трубчатые кости составляют скелет конечностей. Костные выступы на них являются местом прикрепления мышц и связок. Плоские кости состоят из тонкого слоя губчатого вещества, покрытого компактным веществом - лопатка и тазовая кость развиваются из хряща, а кости крыши черепа из соединительной ткани. Короткие кости состоят из губчатого вещества, покрытого тонким слоем компактного вещества. Одной костномозговой полости эти кости не имеют. Красный костный мозг располагается в губчатых ячейках, разделённых костными балками. Кости запястья и предплюсны способствуют большой подвижности кистей и стоп. Смешанные кости находятся в различных отделах скелета (позвоночник, череп). В них сочетаются элементы коротких и плоских костей (тело позвонка и отростки, височная кость). Пневматические или воздухоносные кости имеют внутри полость, выстланную слизистой оболочкой и заполненную воздухом, что облегчает вес кости без уменьшая её прочности.
