Во-первых, поправки пока что не вступили в законную силу, потому что "легитимно" - это вовсе не то же самое, что и "по закону". Легитимность означает готовность большинства населения принять тот или иной порядок вещей и подчиняться ему. Даже если формально там полным-полно нарушений действующего законодательства. Так что г-жа Панфилова, которой по должности полагается следовать букве закона, плохо понимает смысл произносимых ею слов...
Во-вторых, возвращаясь к сути вопроса: "зачем". Зачем всё это затеяно. Затем, чтоб ш-н Путин мог получить свои обновлённые полномочия не от Федерального собрания (как это должно было бы быть по закону), а непосредственно от народа, который типа как источник власти, и тем самым стать выше парламента. Помните, как Лужков, в бытность свою мэром Москвы, стоя на трибуне, прилюдно послал всех депутатов, сказав, что "меня избрал народ, и не вам меня снимать!"? Вот примерно это г-н Путин и имеет в виду. Всенародное одобрение поправок (а что народ их одобрит - к гадалке не ходи, потому что когда ж такое было, чтоб народ Путина не одобрял?!) эквивалентно помазанию от высшей власти, что автоматически делает одну из равноправных, по идее, ветвей власти "равнее других". Просто раньше этой высшей властью считали небесный престол, ну а у нас, как мы светское государство - ведь правда же светское? - высшая власть принадлежит народу. От него и приемлет венец и бармы. Со страхом и смиреньем (с).
В-третьих, опять же по тексту вопроса, "зачем голосовать". Потому что это первый раз за многие уже годы, когда в бюллетене появляется графа "против всех". Появляется квадратик "нет". Это шанс для всех разумных людей, которые понимают истинный смысл затеянного действа, сказать "нет" даже не самим поправкам, а персонально г-ну Путину и той политике, которую он проводит. И упускать этот шанс не следует. Вот за этим.