По разному можно. Самый простой способ - подложить кусочки джинсовой ткани под дырки и прошить на машинке.
А если с креативом, то тут вообще полёт фантазии.
Латать можно практически всем, что под руку попадется - от гипюра под большими дырками, до кожи на любых. Причем, если вырезать латки в форме всевозможных цветочков, силуэтов зверей или даже городов, то получится довольно таки оригинально. Главное, подобрать подходящий цвет ткани. Особенно красиво смотрятся красные цветы, типа мака, на синих и желтые на черных джинсах. Кстати, в цветы можно еще вшить немножко зеленой ткани, вместо тычинок и пестика. Это, если попроще. А посложнее - сделать из бахромы тычинки и из кусочка ткани пестик. В результате цветок станет даже объемным.
Это, что касается колошин.
А на потертости можно вырезать большую латку в форме птицы, например, и пришить так, чтобы хвост прикрыл потертости, а развернутые крылья легли на попе. Весьма оригинально смотрится, но, цвет латки не должен контрастировать с джинсами. Желательно взять именно джинсовую ткань. Можно еще добавить заклёпки, если Вам нравится такой стиль.