Станислав Сергеевич Говорухин родился 29 марта 1936 года в городе Березники (сейчас - Пермский край). О родителях Говорухина известно мало. Мать была портнихой,отец - донским казаком, репрессирован вскоре после рождения сына, умер в 1938 году.
Станислав в 1958 году закончил геологический факультет Казанского государственного университета им. В.И. Ульянова-Ленина (Казанский (Приволжский) федеральный университет), но геологом так и не стал, увлекся кино и в 1966 году стал выпускником режиссерского факультета ВГИКа, затем работал на Казанской студии телевидения, затем на Одесской киностудии. Его первым фильмом стала знаменитая "Вертикаль" (1967, снята вместе с Борисом Дуровым), в которой блистательно сыграл и спел Владимир Высоцкий.
На Одесской киностудии были сняты самые яркие работы Говорухина:
"Жизнь и удивительные приключения Робинзона Крузо" (1972),
"Приключения Тома Сойера и Гекльберри Финна" (1981),
"В поисках капитана Гранта" (1985),
"Десять негритят" (1987),
"Пираты XX века" (1979), автор сценария и актер.
Снимал Станислав Говорухин и советские телесериалы: "Место встречи изменить нельзя" вновь с Владимиром Высоцким в главной роли.
Говорухин стоял у истоков российских кинофестивалей. В 1987 году был президентом кинофестиваля "Одесская альтернатива", с 1988 году - "Золотой Дюк" (фестиваль жанрового кино).
С началом перестройки Станислав Говорухин стал снимать злободневные документальные фильмы, что сделало его не только именитым режиссером, но и политическим деятелем. Начало нового периода в его жизни также было связано с переходом на "Мосфильм". Также он печатал статьи в "Литературной газете" и "Советской культуре", снял интервью с Александром Солженицыным.
С 1993 года по 2018 год Говорухин был депутатом Государственной Думы (представлял Демократическую партию, организовал собственный блок, был членом блока "Отечество - вся Россия", которая в дальнейшем стала частью "Единой России").
Говорухин в 2000 году баллотировался на пост президента РФ, занял восьмое место среди одиннадцати претендентов.
Последнее время Говорухин много болел.
14 июня 2018 году он скончался от острой сердечной недостаточности в подмосковном санатории "Барвиха".
Говорухин был дважды женат. Единственный сын Сергей умер в 2011 году.