Как правило, это совсем не сложная процедура. Обычно достаточно письменного заявления абитуриента, чтобы получить обратно подлинник документа в тот же день, в крайнем случае - на следующий день, если заявление было представлено в приемную комиссию позже, чем за два часа до окончания рабочего дня.
Но, как говорится, из любого правила имеются исключения. Может статься так, что вуз будет намеренно тянуть время в связи с тотальным недобором. Поэтому заявление лучше представить в двух экземплярах, причем на своем очень даже неплохо иметь отметку о принятии.
Ну а если после принятия этих мер предосторожности аттестат так и не вернули в положенные сроки, следует идти с новым заявлением (опять таки написанном в двух экземпл.), но уже не в приемную комиссию, а в приемную ректора, при этом можно не стесняться и упомянуть в тексте о персональной ответственности руководителя вуза за нарушение сроков.
Если же и эта мера не помогла, то остается одна дорога - в Рособрнадзор.