Разница, во-первых, в возрасте. Наташа больше и подробнее всего описана юной, непосредственной девушкой, одарённой способностью любить жизнь и не бояться чувства.
Анна же - давно перешагнула пору юности - тем более, по тем временам, ей около 25 лет, она светская дама, замужняя за государственным лицом и ещё и мать.
Можно пытаться выискивать сходства, ища героинь в одинаковом возрасте, но в этом нет смысла: Наташа, по сути росла на глазах Толстого - её прототипом была младшая сестра Софьи Андреевны, Танечка Берс. С семьёй Берс Толстой был знаком многие годы, и все три старшие девочки вырастали у него на глазах. Он едва не увлёкся старшей Лизой, так что все начали полагать, что он будет её женихом, но неожиданно он обратился к Соне, и всё получилось, как получилось. Таня на тот момент была ещё подростком. Он правда, говорил, что "взял Таню, перетолок с Соней и получилась Наташа" - но это опровергали многие его современники и родные этих двух семей, утверждая, что Наташа - это только Таня (в замужестве Кузьминская) Слишком похожи были черты, детали, ситуации, события из жизни... И пение, и увлечение, стоившее здоровья, в общем, Наташа - это как бы девушка из его семьи, любимая и близкая.
В то время как история Анны далека от его семейного круга. Это образ встроен в великосветское общество, которое не было любимо и ценимо ни самим Толстым, ни женщинами его близкого круга.
Однако, Толстой никогда не поставил бы в центр романа холодную и расчётливую героиню. Он написал Анну как женщину цельную и прямую, чуждую великосветской морали и поэтому бесстрашно эту мораль поправшую. Этот шаг может сделать только женщина, обладающая чистым и глубоким чувством, то есть, способная любить.
Поэтому этим героини сходны.
Сходны и любовной историей: и одна и другая увлеклись блестящим светским героем. Герои несколько разнятся: Анатоль просто молодой, пустоватый хлыщ, в то время как Вронский - вдумчивый, думающий человек с идеями и планами. Но между прочим, в обоих экранизациях и Курагина и Вронского играет один и тот же актёр - Василий Лановой. Любопытная черта... ))
В общем, наверное, если бы Наташа выросла не в радушной, яркой, щедрой атмосфере дома Ростовых, а в великосветской семье, а потом полюбила бы - думаю, она так же, как Анна, пошла бы за чувством, она спасала бы свою душу, а не достоинство и не репутацию.