Есть три способа организовать работу быстрее на такого типа дисках:
1) ОС на ssd, пользовательские файлы на hdd. У меня так все и устроено на ультрабуке. ОС грузится очень быстро, где-то 7 секунд.
Проблема одна - у меня ssd на 16 гигабайт, а ОС занимает 22 гб. Пришлось ручками ее поковырять и перераспределить некоторые файлы на hdd. Два года, все нормально работает. У ssd дисков с большим объемом таких проблем не будет.
2) ОС и файлы пользователя на hdd, ssd диск используется как ExpressCache. Это означает, что ОС будет помещать на ssd диск файлы, к которым чаще всего идет обращение на чтение. Ускорится работа как ОС, так и приложений. Грузиться ОС будет чуть дольше, чем если бы она вся была на ssd, но не критично - на пару секунд. Этот вариант предлагается вендорами как основной.
3) ОС и приложения на hdd, с ssd работаете сами. До обновления компьютера на работе у меня была именно такая система. Мне не жалко было подождать пару минут на загрузке, но вот рабочие процессы сборки приложений я запускал на ssd диске. Полная пересборка одного из самых "тяжелых" проектов на hdd занимала 8 минут, а на ssd около 4.