Физули народився в місті Кербела на півдні арабського Іраку. Точна дата народження поета не встановлена. Прийнято вважати, що він народився в 1498 році, проте судячи за деякими даними, що містяться в деяких творах поета, він народився значно раніше, в 1480-х рр [32]. На думку польського сходознавця С. Плясковіцка-Римкевіч поет народився в Кербелі, імовірно між 1488-1504 роками, але скоріш за все не пізніше 1495 [33]. Даних про біографію Физули дуже мало, згідно Енциклопедії Британіка поет мабуть походив з родини релігійних діячів [1]. Згідно пізнішим переказами батько поета служив муфтієм в місті Хіллі, однак достовірних даних про це немає. Судячи з того, що молодому Мухаммеду вдалося здобути блискучу для того часу освіту, можна припустити, що батько поета володів відповідним достатком. Освіченість поета підтверджується його релігійними титулами: мулла і Мевлана. Літературний смак був щеплений Физули поетом Хабібі [34].
Сучасник поета Садки в своїх біографічних мемуарах про поета повідомляє, що Физули походив з огузского племені Баяти [35], інший сучасник поета, Нідал Челебі, пише, що Физули належав до туркоманам Ак Коюнлу [36]. Енциклопедія Іраніка і ряд сучасних дослідників також вважають, що Физули походив з тюркського племені Баяти, що осів в Іраку [37] [38] [39], представники якого кочували на просторі від Закаспія до Сирії [40]. Британський орієнталіст Еліас Гібб першим вказав у своїй роботі, опублікованій в 1882 році, що Физули, можливо, був азербайджанським тюрком [41]. Радянський сходознавець, іраніст і тюрколог Е.А. Бертельс у своїй книзі «Нізамі та Физули» називає поета «великим ліриком, що відбувалися з азербайджанського племені Баяти» [42]. Чеський філолог-сходознавець Ян Ріпка у своїй книзі «Історія перської та таджицької літератури» і радянський історик-сходознавець А. Ю. Кримський у своїй книзі «Нізамі та його сучасники» називають Физули «азербайджанцем» [43] [44]. Енциклопедія Ларусса і деякі сучасні дослідники вважають, що поет міг мати курдське походження [22] [45] [46]. Турецький літературознавець, дослідник творчості поета, Хаміде Демірель (Hamide Demirel, Hamide Odelli), констатує, що деякі дослідники стверджують про курдському або перське походження Физули, при цьому, на думку автора, вони не призводять будь-яких доказів або джерел даного твердження. Так, в 1922 році версія про перське походження була озвучена літературознавцем Реза Тавфіком (Riza Tawfiq), на початку XX століття про курдському походження поета згадували у своїх роботах Д. Хьюарт (C. Huart) і А. Кримський, однак на думку Хаміда Демірель ці автори не обґрунтували свої твердження. Автор досліджуючи творчість поета і зокрема передмову поета до свого перського «Дивану», зазначає, що тюркська мова була рідною мовою Фізулі і приходить до висновку про тюркських коренях поета [47].
Портрет Физули. Худ. Азім Азімзаде, 1914. Національний музей мистецтв Азербайджану, БакуЗа віросповіданням Физули був мусульманином-шиїтом [48]. При цьому деякі дослідники вважали, що Физули був сунітом, ряд інших робили припущення, що поет був хуруфітом, алевіти, належав до секти Бекташі. На думку фахівця з тюркської літературі, фізуліведа Абдулкадир Карахана (Abdulkadir Karahan), в цілому творчість поета свідчить про те, що у своїх релігійних поглядах «він був вище сектантства та різних течій у своєму суфийском підході» [47].
Швидше за все, освіта поет почав отримувати в Кербелі і лише потім продовжив навчання в Хіллі та Багдаді [34]. У Багдаді поет вивчав медицину, астрономію, логіку, математику, а також давньогрецьку і східні філософські системи. Був знайомий з працями Аристотеля і Платона. Тексти його творів вказують на те, що Физули був знайомий з творчістю Хагані, Нізамі, Хабібі, Насими.
»У передмові до свого турецькому «дивану» поет говорить про своє природженому артистичному темпераменті і вказує на те, що він почав писати вірші ще в ранньому віці. Його перший відомий вірш касида було присвячено Алвенду, онукові правителя держави Ак-Коюнлу Узун-Гасана. Коли сефевидский правитель Шах Ісмаїл Хатаї захопив Багдад в 1508 році, Фізулі був уже досить відомий як молодий поет і людина з літературними та релігійними здібностями. Він присвятив шахові Ісмаїлу Хатаї свій перший месневі «Бенг у Баде». За часів правління Сефевідів поет користувався заступництвом місцевих правителів персидського шаха, і це тривало до османського завоювання Багдада в 1534 році. Згодом поет присвятив кілька касид Сулейману Прекрасному, а також придворним османським вельможам: головному візиру Ібрагіму-паша Паргали, Кади Аскеров Челебі, Джалал-заде Мустафи Челебі. У цей період Физули зустрічався в Багдаді з відомими придворними османськими поетами, Хаялі і Ташлиджали Ях'я. Таким чином поет добився розташування османського султана та його двору і почав отримувати матеріальне забезпечення тепер уже від османських правителів Багдада [49].
Відомо, що у Физули був син на ім'я Фадль Челебі.
<span>Помер Физули в 1556 році під час епідемії чуми [50].</span>
