Конечно в самом вопросе не упоминается в каком статусе находится военнослужаший. Поэтому я рассматриваю варианты как для военнослужащего по призыву, так и проходящего военную службу по контракту.
Касаемо первого варианта, то в соответствии с действующим законом, а это "О статусе военнослужащих", военнослужащим по призыву, обучение в высших учебных заведениях не разрешается ни в какой форме, в т.ч. и по заочной.
При призыве такого учащегося в армию, учебное заведение предоставляет на срок службы, а это 1 год, отсрочки, с сохранением права на продолжение обучения. Иными словами никакие гос.экзамены такому военнослужащему, в период службы, сдавать не нужно. Все это это будет перенесено до момента окончания службы.
Если вопрос связан с военнослужащим по контракту, то здесь так же, согласно действующего закона, возможен перенос сдачи экзаменов. Для этих целей необходимо в части взять справку-ходатайство, в которой указывается причина невозможности предоставления военнослужащему учебного отпуска, к примеру такими вескими причинами могут быть учения, занятия по боевой подготовке, длительные служебные командировки и др.
Обращение в суд, думаю, вообще является бессмысленной идеей, так как никакой судья не может опротестовать федеральный закон.Если придется судиться, то только с учебным заведением, который не выполняет требования закона.