Для того чтобы понять сюжет игры F.E.A.R. нужно переместится примерно на 20 лет назад,когда компания ATC получила правительственный заказ на создание отряда клонов,управляемых телепатом на расстоянии.
Тут появляется сотрудник этой же компании-Хернел Уэйт вместе с дочерью Альмой.Неизвестно,каким образом альма получила мощные телепатические способности.
Но,она оказалась непригодной для компании,т.к. оказалась крайне агрессивной,склонной к бессмысленным убийствам психопаткой.
Поэтому было принято погрузить её в кому,поместить в специальную капсулу до достижения ею детородного возраста.Своего первого ребенка Альма родила в 15 лет.Зетем родился и второй сын
Первый сын(ГГ) не обладал телепатическими способностями поэтому его сочли неудачным.А второй(Феттел) обладал не только телепатией но и был управляем.Но скоро Альма установила телепатическую связь с Феттелом,она влияла а него так сильно,что он начал вести себя неадекватно и убил несколько человек.Было решено убить альму,отключив её от аппарата жизнеобеспечения.Она не умирала целых 6 дней.
Руководство решило оставить дух Альмы,решив что большого вреда от него не будет.
Но в скоре в близлежащем поселке начали происходить странные события.Люди начали сходить с ума.Сомнений не осталось-эт одело рук духа Альмы.
Руководство решает открыть капсулу и испепелить дух Альмы.Но солат которые зашли в помещение разрывает на части и дух Альмы вырывается на свободу.
Рагребанию этой всей кучи мы и будем заниматся на протяжении первой части игры)