Это зависит от того, какой вирус.
Если он появляется в диспетчере задач как отдельный процесс, то можно просто заблокировать его запуск при старте компьютера (тут инструкция как это сделать), хотя иногда это может быть сразу несколько процессов или запускаться они могут не при старте, а с заражённого нужного процесса. Тогда не получится таким способом.
Ещё можно сделать обновления, например загрузив их с сайта, либо сделав это вручную. В эффективность первого не очень верится, а вот если обновить компоненты вручную, то можно почистить от вирусов некоторые системные файлы.
Для этого нужно переустановить системные программы Windows.
Чтобы это сделать запустите:
Пуск → Панель управления → "Установка и удаление программ" и там выберите "Установка компонентов Windows":
Затем выберите компоненты, которые хотите переустановить и нажмите "Далее".
Вам понадобится DVD диск с вашей операционной системой для переустановки компонентов.
Ещё вместо всего этого можно сделать "Восстановление системы" на какую-нибудь старую дату, когда вируса точно ещё не было. Но это помогает не всегда, серьёзные вирусы могут так сделать, что после восстановления системы вылезет системная надпись, говорящая, что систему не удалось восстановить.