Зачастую так спрашивают, когда разговариваешь по телефону, или, как вариант, в переписке по интернету: "почему ты молчишь (не пишешь)?". В разных случаях нужно по-разному и отвечать, как по шаблону на все случаи жизни здесь не подойдёт. Обычно отвечаю в таком духе:
"Я не молчу, я внимательно слушаю твою тишину".
"Я не молчу, это за меня интернет молчит".
"Молчу, потому как у меня такие мысли в голове, что озвучить их страшно".
"А я молчу? Надо же, я даже не заметила".
"А зачем мне говорить, ведь я не вижу, что меня слышат".
"Мой язык и мозг за день устали, вот и дают друг другу отдохнуть".
"Зачем мне говорить, если ты это делаешь лучше".