Самые крупные притоки Енисея находятся с правой, восточной стороны - это Ангара, Кан, Подкаменная Тунгуска, Нижняя Тунгуска, Курейка, Большой Пит, Мана, Туба, Хантайка, Дудинка. С левой стороны в Енисей впадают в основном реки помельче - Хемчик, Абакан, Сым, Елогуй, Турухан, Танама, Малая Хета, Большая Хета.