Учитывая, что наиболее "болевые", напичканные нервными окончаниями места у рыбы находятся на глазах и жабрах, то умирая, будучи пойманной, разумеется, испытывает боль.
Попробуйте подержать глаза широко открытыми и не моргать долгое время - такая резь будет от высыхания!
Кстати, болевые ощущения рыбы зависят от температуры. Поэтому можно заморозить рыбу живьем, чтобы не страдала, и, потом разморозить и выпустить плавать в ванну.
Именно потому, что рыба испытывает боль (и, соответственно, стресс), грамотные рыбаки сразу отсекают ей голову после поимки.
Иначе мясо рыбы ощутимо теряет во вкусе.