Думаю, все зависит от позы просмотра фильма. Возможно, еще от размера монитора и звука.
Пусть и по телевизору идут рекламы, а как раз в них и может быть дело, ведь мы к ним привыкли. Ну представьте, раньше, всю жизнь смотрели фильмы по телевизору, вставая каждый полчаса вовремя рекламы. Вы привыкли. А здесь, включил и смотришь. Все время, без остановки, без той самой рекламы. Тем более, за компьютером мы обычно сидим, а поза тут может оказать решающее влияние. Обычный пример: иногда включал фильм на ноутбуке и ложился на диван. Смотрел и вполне нормально, практически как при просмотре телевизора. На телевизоре (во благо цивилизации он с доступом к интернету) смотрел фильм из интернета, без реклам и т.д., все более чем два часа лежал и спокойно смотрел.
Но вот когда просмотр начинается сидя прямо перед монитором, что-то случается. А может и с глазами что-то, ведь компьютер значительно ближе, да и излучение от него интенсивнее, поэтому глаза устают быстрее, появляется общая усталость организма. Еще такой вариант - компьютеры требуют много влаги (не зря же мы все кактусы ставим), а мы, люди, процентов на 80 состоим из воды... ну вы поняли к чему я клоню) Это может тоже таки вызывать усталость и различные неудобства. Причин, в принципе, может быть масса, но основные, которые имеют право на существования, я назвал выше. Все-таки какая-то из них, хотя, скорее всего, их совокупность, делают же просмотр фильма на телевизоре интересней, нежели на компьютере.