Я думаю, что чеченцы не очень то советскую власть приняли. Они всегда стремились жить по своим традициям и законам. С приходом советской власти и до самого начала второй мировой, в Чечне было несколько антисоветских восстаний .В 1940 году началось последнее, во главе с Хасаном Исраиловым ,и подавлено оно было только в 1944 году... Пользовалась ли это восстание массовой поддержкой или нет не знаю, но повстанцы вели пропаганду среди местного населения, писали воззвания ,призывали к сотрудничеству с немцами, при этом говорилось ,что Чечня обретёт полную независимость.
Что за личность Исраилов не понятно, но сказать, что он пользовался какой то популярностью у Чеченцев видимо нельзя, он вообще в какой то тени находился всегда. Например большей популярностью, даже в 90 е годы, прошлого века, в Чечне пользовался герой Советского Союза Ханпаши Нурадилов, погибший при обороне Сталинграда, в 1942 году .
А Исраилов, может как его украинский коллега Бандера, полагал что пока там два гиганта СССР и Германия меж собой разбираются, мы тут свою самостийность устроим...
Возможно, что Сталин и выслал чеченцев, лишил так сказать корней ,что бы подавить их сопротивление Советской власти . У Сталина разговор был короткий, никаких компромиссов он не признавал, не хотите жить по законам советской власти ,тогда в вагоны и в степь... а сотрудничество с немцами и повстанцы Исраилова ,были просто предлогом. Подобные претензии, при желании можно было предъявить любому народу, попавшему в зону оккупации.
Главная причина, видимо неприятие Советской власти в Чечне, но наверняка не могу сказать.