Если речь идет не о ничтожных,а о значимых суммах (Вы не пишете,на сколько не идет касса),то предпринимайте никаких действий,ведущих Вас в тупик, сообщите вышестоящему руководству (администратор,старший кассир). Но прежде пересчитайте несколько раз. По идее,если Вы работаете на кассе, не сходится может только в следующих случаях,если Вы обсчитались,давая сдачу,допустим, приняли купюру низкого достоинства за более крупную, "передали" лишнюю сумму сдачи. Если Вы это исключаете,то остается лишь вариант изъятия денег из кассы посторонними. Но кассы сейчас автоматические,такое тоже маловероятно.
По идее,Вам придется возмещать недостачу. Если сумма слишком большая,поговорите с руководством о рассрочке в погашении,но это опять же ,если никто у Вас ничего не ворует. Повторяю, выгрузите кассовый отчет и еще раз сверьтесь,может,Вы действительно обсчитались.