Гуппи подвержены многим заболеваниям. Это может быть и инфекция и заражение, через пищу и т. д.
Из указанных симптомов и течения заболевания — больше подходит Нарывная болезнь. Это когда рыбки покрываются нарывами, твердыми изначально, но затем лопающимися. Глубокие раны повреждают не только кожу у рыбок но и мускулатуру. Рыбки заболевшие Нарывной болезнью погибают от истощения. Это не излечимо и чтобы болезнь не распространилась на других обитателей аквариума — инфицированных особей следует изолировать и уничтожать.
Рыбки подвержены и язвенным заболеваниям. Чаще такому подвержены мальки. Это воспалительный процесс кожи и мышечной ткани, когда появляются фурункулы на теле переходящие в открытые кровоточащие ранки. Для лечения можно использовать стрептоцид (5 г на 10л воды); или бициллин ( 5 г. на 100 литров воды).
Третьим заболеванием, похожим на Вами описанное, является Аэромоноз. Здесь заражение происходит через повреждения кожи или жабры. Течение заболевания выражается наличием красных пятен. Что плохо, что рыбки переболевшие этой болезнью, вырабатывают иммунитет, но потом сами становятся распространителями инфекции.
Мое мнение, что всех заболевших рыбок в первую очередь нужно изолировать, что бы не спровоцировать распространение заболеваний среди других. А уже потом пытаться лечить заболевших + произвести генеральную уборку в аквариуме.