Снаружи семя покрыто семенной кожурой, которая защищает семя от высыхания и повреждений.На вогнутой стороне семени есть рубчик - след от семяножки, которым оно соединялось с околоплодником.
Под семенной кожурой находится зародыш, состоящий из 2-х семядолей и расположенных между ними стебелька. корешка и почечки.
В крупных семядолях находятся питательные вещества.
Цветковые зародыши имеющие две семядоли - называются двудольными(яблоня, морковь,дуб, астра).
Лютик и фиалка имеют зародыш окруженный эндоспермом - особые клетки, содержащие запас питательных веществ.
Семена злаковых, таких как рожь, кукуруза, пшеница имеют иное строение. Например зерновка пшеницы снаружи имеет кожистый околоплодник, сросшийся плотно с сменой кожурой. Большую часть зерновки занимает мучнистый эндосперм. Зародыш имеет корешок, почечку и стебелек. Но семядоля у него одна. Она похожа на тонкую пластинку, плотно прилагающую к эндосперму. Растения имеющие одну семядолю называют однодольными.
Семена однолетних, таких как лук и ландыш тоже имеют эндосперм, но он окружает зародыш, а не прилегает к нему со стороны ка у злаков.