Основная версия, что имя Мэрилин - от Монро, а фамилия Мэнсон - от Чарльза Мэнсона. Однако известно, что до начала карьеры Брайан Хью Уорнер читал книгу, где главной героиней была начинающая певица Мэрилин Мэнсон. Возможно, на самом деле этот персонаж запал в душу будущему шок-рокеру, а уже потом он подвел свое имя под Монро и известного маньяка.
Этот псевдоним сыграл с музыкантом злую шутку: когда умер Чарльз Мэнсон, некоторые СМИ всё перепутали, и написали, что умер Мэрилин Мэнсон, так как к тому времени фамилия "Мэнсон" уже прочно ассоциировалась с певцом.
Еще интересный момент: ММ уверяет, что даже родители стали называть его именно Мэрилином, а не Брайаном. Но Антону Шандору Лавею Мэнсон позволил называть себя настоящим именем, так как Лавей любил Мэрилин Монро.