Это зависит от образа компании.
Название может быть и шуточным, если образ непринужденный и вы собираетесь устанавливать доверительные отношения с каждым клиентом. Например, "Крокодил", "Колобок" и т. п.
Если все солидно, консервативно, и соблюдается дистанция, то хороши приставки "авиа-", "транс-", "лог-" (от слова логистика), "авто-".
Хороши также просто слова, которые ничего не значат, но красиво звучат. Разные слова звуками вызывают разные ассоциации. В случае транспортной компании они должны звучать свежо, современно, динамично, то есть содержать соответствующие буквы, особенно букву "с" (динамика, стремительность), букву "а" (лидерство). Желательно кратко. Например, как слово "алиас".
А вообще, бренднейминг - штука дорогая, мой ответ очень поверхностен, но надеюсь, хоть чем-то помогла. Если определитесь с образом, то отвечающим будет легче.