Дело было вовсе не в разной религии.
Господствующей религией в ВКЛ вначале было, кстати, православие, а не католичество. Протом начало действительно проникать католичество, да, но с большинством православного населении и доминированием православной беларуской шляхты - католикам-магнатам в Вильне приходилось все-таки считаться .
Этнические литовцы занимали в ВКЛ не более 10%. И не они стояли у руля государства, а литвины - средневековые беларусы и ославяненные балты.
Ибо даже государственным языком ВКЛ был старобелорусский:
(титульный лист первого издания Статута ВКЛ 1588 года из Вильно)
Дело скорей было в менталитете - нравы и мировоззрение магнатерии и шляхты в ВКЛ были проевропейско-демократические: право вето, нерушимые вольности шляхты, парламентская шляхетская республика, выборность и конституционная ограниченность власти короля..
Все эти веяния именно шли в ВКЛ с Запада, из Европы и через Польское Королевство, которое само было самым близким, соблазнительным и доступным образцом конституционной монархии и панской республики ( слово Rzeczpospolita - дословный перевод на польский латинского слова "Res publica", "Республика").
Московия же могла предложить только азиатскую деспотию, абсолютное самодержавие и холопское и бесправное положение даже аристократии и шляхтичей перед царем.
Что было неприемлемо для власть имущих в ВКЛ ( и в союзной Короне Поьской).
Стать на колени перед монархом и целовать его ноги, называя себя "твоим холопишком, батюшка царь", не иметь никаких прав в управлениии страной, и покорно сложить на плахе голову просто по капризу московского царя - было дико и невозможно для гордых и свободолюбивых беларуско-литовских шляхтичей и магнатов, привыкших избирать своего вел.князя/короля, отменять его указы "правом вето" в Раде и в Сейме, и даже законно объявлять ему рокош (право на военный бунт против монарха для защиты своих прав и свобод).