Вы правы. Баллы к репутации добавляются не только за вопросы (+1) и ответы (+7), но и в других случаях.
Например, баллы приносят некоторые награды - "Автобиограф", "Снайпер", "Автор дня", "Лидер" и другие. Все награды.
Также начисляются баллы автору за ответ, который выбран Лучшим (+10). И За выбор Лучшего ответа самим автором вопроса ему тоже прибавляется балл (+1).
Это то, что относится к вопросам и ответам.
Но все мы понимаем, что на сайте есть ряд правил и и в соответствие с ними должен поддерживаться порядок на сайте. Конечно для этого есть модераторы. но они тоже живые люди и просто физически не могут зайти в каждый вопрос и всё перепроверить.
Поэтому есть у вопросов, ответов, комментариев кнопочка "Замечание". И в ряде случаев человек, отправивший жалобу (на рекламу, оскорбления, дубль), получает баллы за помощь модераторам.
Например за дубли. Правилами запрещено дублирование.
У меня тоже закрывали вопрос за дублирование. Но я считаю, что лучше сразу, чем через полгода (когда у тебя уже куча ответов и начисляются кредиты) обнаружится, что год назад такой вопрос уже задавали.