Проще всего было бы сказать, что причина крылась в устранении различий в отправлении обрядов и текстов богослужебных книг с греческой церковью, бывшей законодательницей церковных правил.
Но это лишь видимая часть. Чтобы понять истинные причины, надо вспомнить, что ближе к середине 17 века были предприняты шаги к укреплению царской власти - абсолютизму (Соборное уложение). Церковь в результате этого стала терять влияние и, что хуже всего, земли и финансовую составляющую.
Поэтому патриарх в первую очередь был обеспокоен укреплением централизации русской церкви аналогично государственному аппарату. К тому же в 1653 году произошло присоединение к России территорий, отторгнутых Польшей и Литвой, так называемое "воссоединение Украины и России". И это как раз и толчок к реформе.
Но, как оказалось, повод был выбран не совсем верно, так как возникли разногласия с приверженцами традиционных обрядов, ведущих историю ещё со времён крещения Руси. Произошёл раскол церкви именно на почве унификации правил и обрядов, проводившихся по требованию греческой церкви, которая ставила это во главу угла в вопросе сближения с русской православной церковью.
Таким образом, расставляя приоритеты причин проведения реформы, на первое место можно поставить стремление к централизации путём сближения к греческим православием, а затем восстановившиеся связи с южнославянскими народами, повлекшими за собой необходимость правки церковных книг.
Итог реформы был плачевен: разрыв с царём и раскол церкви.