Основных козырей нет, разные преимущества Linux'а ценны по своему.
Вот некоторые из них:
Вес. Система очень лёгкая по сравнению с детищем Microsoft, установленный и распакованный Linux Mint, к примеру, весит всего 4.8 ГБ(вместо 40), причём существуют "линуксоиды", весящие и того меньше, самый лёгкий - Tiny Core весит 50 МБ.
Быстродействие. Линуксы никогда не заставят ваш компьютер "выть" всеми вентиляторами при каком-нибудь обновлении тяжёлой игры или программы, а на SSD они вообще летают в прямом смысле со скоростью света! Вообще система удобна для слабых компьютеров и ноутбуков.
Гибкость системы. Предустановленных приложений нет, при установке системы единственное, просто начните устанавливать систему с помощью Net Installer и выберете всё, что вам нужно. Нужна готовая система с калькуляторами, проигрывателями и офисами? Необязательно корпеть над проставлением галочек, можно просто скачать дистрибутив, где всё это есть по умолчанию. Кроме того, такую операцию можно проделать когда угодно. Также, можно полностью поменять конфигурацию, внешний вид, интерфейс и всё остальное, что душе угодно. Причём кардинально, можно вообще забабахать себе 3D-систему с 4-мя разными рабочими столами.
Обновления. Принудительные обновления отсутствуют(это когда вы включаете компьютер, и у вас на весь экран "Идёт установка обновлений Windows"), все патчи устанавливаются фоном, перезагрузить компьютер для использования новой версии вы можете когда угодно. А можете вообще не устанавливать новые версии. Собственный магазин В Linux просто огромный, причём абсолютно всё, что там есть, бесплатно, а есть там всё, причём буквально: не найденные приложения магазин ищет в репозиториях(сетевые источники).